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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Amazônia Ocidental. |
Data corrente: |
23/01/2013 |
Data da última atualização: |
05/02/2018 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
SANTANA, M. F.; SILVA, J. C. F.; BATISTA, A. D.; RIBEIRO, L. E.; SILVA, G. F. da; ARAÚJO, E. F. de; QUEIROZ, M. V. de. |
Afiliação: |
MATEUS F. SANTANA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; JOSÉ C. F. SILVA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; ALINE D. BATISTA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; LILIAN E. RIBEIRO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; GILVAN FERREIRA DA SILVA, CPAA; ELZA F. DE ARAÚJO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; MARISA V. DE QUEIROZ, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA. |
Título: |
Abundance, distribution and potential impact of transposable elements in the genome of Mycosphaerella fijiensis. |
Ano de publicação: |
2012 |
Fonte/Imprenta: |
BMC Genomics, v. 13, n. 1, p. 1-11, Dec. 2012. |
ISSN: |
1471-2164 |
DOI: |
10.1186/1471-2164-13-720 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Mycosphaerella fijiensis is a ascomycete that causes Black Sigatoka in bananas. Recently, the M. fijiensis genome was sequenced. Repetitive sequences are ubiquitous components of fungal genomes. In most genomic analyses, repetitive sequences are associated withtransposable elements (TEs). TEs are dispersed repetitive DNA sequences found in a host genome. These elements have the ability to move from one location to another within the genome, and their insertion can cause a wide spectrum of mutations in their hosts. Some of the deleterious effects of TEs may be due to ectopic recombination among TEs of the same family. In addition, some transposons are physically linked to genes and can control their expression. To prevent possible damage caused by the presence of TEs in the genome, some fungi possess TE-silencing mechanisms, such as RIP (Repeat Induced Point mutation). In this study, the abundance, distribution and potential impact of TEs in the genome of M. fijiensis were investigated. |
Palavras-Chave: |
RIP; Transposable elements. |
Thesagro: |
Mycosphaerella Fijiensis. |
Thesaurus Nal: |
genome. |
Categoria do assunto: |
-- |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/172156/1/Abundance.pdf
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Marc: |
LEADER 01771naa a2200265 a 4500 001 1946093 005 2018-02-05 008 2012 bl uuuu u00u1 u #d 022 $a1471-2164 024 7 $a10.1186/1471-2164-13-720$2DOI 100 1 $aSANTANA, M. F. 245 $aAbundance, distribution and potential impact of transposable elements in the genome of Mycosphaerella fijiensis. 260 $c2012 520 $aMycosphaerella fijiensis is a ascomycete that causes Black Sigatoka in bananas. Recently, the M. fijiensis genome was sequenced. Repetitive sequences are ubiquitous components of fungal genomes. In most genomic analyses, repetitive sequences are associated withtransposable elements (TEs). TEs are dispersed repetitive DNA sequences found in a host genome. These elements have the ability to move from one location to another within the genome, and their insertion can cause a wide spectrum of mutations in their hosts. Some of the deleterious effects of TEs may be due to ectopic recombination among TEs of the same family. In addition, some transposons are physically linked to genes and can control their expression. To prevent possible damage caused by the presence of TEs in the genome, some fungi possess TE-silencing mechanisms, such as RIP (Repeat Induced Point mutation). In this study, the abundance, distribution and potential impact of TEs in the genome of M. fijiensis were investigated. 650 $agenome 650 $aMycosphaerella Fijiensis 653 $aRIP 653 $aTransposable elements 700 1 $aSILVA, J. C. F. 700 1 $aBATISTA, A. D. 700 1 $aRIBEIRO, L. E. 700 1 $aSILVA, G. F. da 700 1 $aARAÚJO, E. F. de 700 1 $aQUEIROZ, M. V. de 773 $tBMC Genomics$gv. 13, n. 1, p. 1-11, Dec. 2012.
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Ocidental (CPAA) |
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Registros recuperados : 16 | |
2. | | BASSO, M. F.; FAJARDO, T. V. M.; SILVA, J. C. F.; ALFENAS-ZERBINI, P.; ZERBINI, F. M. Association of a novel highly divergent monopartite circular ssDNA virus with chlorotic dwarf and dry branches in apple and pear and potential association with symptoms in grapevine. In: INTERNATIONAL GEMINIVIRUS SYMPOSIUM, 7.; INTERNATIONAL SSDNA COMPARATIVE VIROLOGY WORKSHOP, 5., 2013, Hangzhou. Program and abstracts... [S.l.: s.n., 2013]. p. 56.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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3. | | VIEIRA, S. B.; CARVALHO, J. O. P. de; RUSCHEL, A. R.; GOMES, J. M.; SILVA, J. C. F. da. Comportamento de mudas de Cedrela odorata L. (cedro-vermelho) plantadas em clareiras causadas por exploração florestal no município de Paragominas. In: SEMINÁRIO ANUAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 8.; SEMINÁRIO DE PESQUISA DA UFRA, 2., 2010, Belém, PA. Agricultura, pecuária e floresta: integração para sustentabilidade da produção e biodiversidade da Amazônia. Belém, PA: UFRA, 2010.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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4. | | VIEIRA, S. B.; CARVALHO, J. O. P. de; GOMES, J. M.; SILVA, J. C. F. da; RUSCHEL, A. R. Comportamento de mudas de Tabebuia impetiginosa (Mart. ex DC.) Standl. (ipê-roxo) plantadas em clareiras causadas pela exploração de impacto reduzido, em Paragominas, PA. In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA PARA O PROGRESSO DA CIÊNCIA, 63., 2011, Goiânia. Cerrado: água, alimento e energia: anais. Goiânia: SBPC, 2011.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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5. | | VIEIRA, S. B.; CARVALHO, J. O. P. de; GOMES, J. M.; SILVA, J. C. F. da; RUSCHEL, A. R. Cedrela odorata L. tem potencial para ser utilizada na silvicultura pós-colheita na Amazônia brasileira? Ciência Florestal, Santa Maria, v. 28, n. 3, p. 1230-1238, jul./set. 2018.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Oriental. |
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6. | | BASSO, M. F.; SILVA, J. C. F.; FAJARDO, T. V. M.; FONTES, E. P. B.; ZERBINI, F. M. A novel, highly divergent ssDNA virus identified in Brazil infecting apple, pear and grapevine. Virus Research, v. 14, n. 210, p. 27-33, July 2015.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Uva e Vinho. |
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7. | | SANTANA, M. F.; SILVA, J. C. F.; BATISTA, A. D.; RIBEIRO, L. E.; SILVA, G. F. da; ARAÚJO, E. F. de; QUEIROZ, M. V. de. Abundance, distribution and potential impact of transposable elements in the genome of Mycosphaerella fijiensis. BMC Genomics, v. 13, n. 1, p. 1-11, Dec. 2012.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Amazônia Ocidental. |
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8. | | SILVA, J. C. F. D. DA.; SANTOS, S. A.; SALES, R. L.; CRUZ, L. H. DA.; GARCIA, J. B.; RAVAGLIA, E. Comportamento ingestivo de diferentes categorias de bovinos de corte em pastagens nativas e exóticas durante seca no Pantanal. SIMPÓSIO SOBRE RECURSOS NATURAIS E SOCIOECONÔMICOS DO PANTANAL, 5., 2010, Corumbá, MS. Anais... Corumbá: Embrapa Pantanal: UFMS; Campinas: ICS do Brasil, 2010. 1 CD-ROM SIMPAN 2010. Não PaginadoTipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Pantanal. |
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9. | | MAR, T. B.; XAVIER, C. A. D.; LIMA, A. T. M.; NOGUEIRA, A. M.; SILVA, J. C. F.; RAMOS-SOBRINHO, R.; LAU, D.; ZERBINI, F. M. Genetic variability and population structure of the New World begomovirus Euphorbia yellow mosaic virus. Journal of General Virology, London, v. 98, n. 6, p. 1537-1551, Jun. 2017.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Trigo. |
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10. | | SILVA, I. N. da; IKEDA, F. S.; FUJIMORI, I. S. T.; IEKA, L. F.; BAUERMANN, G. S.; CONTESINI, M. E.; BASILIO, E. R.; FAVARO, L.; SILVA, J. C. F. da. Controle químico em pós-emergência de vassourinha-de-botão perenizada em cultivo de milho. In: JORNADA CIENTÍFICA DA EMBRAPA AGROSSILVIPASTORIL, 12., 2023. Sinop. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2023. p. 42. (Embrapa Agrossilvipastoril. Eventos Técnicos & Científicos, 1)Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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11. | | SANTANA, T. E. Z.; SILVA, J. C. F.; SILVA, L. O. C. da; ALVARENGA, A. B.; MENEZES, G. R. de O.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; DUARTE, M. de S.; SILVA, F. F. e. Genome-enabled classification of stayability in Nellore cattle under a machine learning framework. Livestock Science, v. 260, article 104935, 2022.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Corte. |
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12. | | LIMA, L. L.; BALBI, B. P.; MESQUITA, R. O.; SILVA, J. C. F. da; COUTINHO, F. S.; CARMO, F. M. S.; VITAL, C. E.; MEHTA, A.; LOUREIRO, M. E.; FONTES, E. P. B.; BARROS, E. G.; RAMOS, H. J. O. Proteomic and metabolomic analysis of a drought tolerant soybean cultivar from Brazilian savanna. Crop Breeding, Genetics and Genomics, v. 1, article e190022, 2019.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: C - 0 |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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13. | | IKEDA, F. S.; CAVALIERI, S. D.; FUJIMORI, I. S. T.; SILVA, I. N. da; CONSTESINI, M. E.; BASILIO, E. R.; SILVA, J. C. F. da; FÁVARO, L.; IEKA, L. V. F.; BAUERMANN, G. S. Seletividade inicial de herbicidas aplicados em pós-emergência em cultivares de gergelim. In: SIMPÓSIO DE HERBICIDAS E TECNOLOGIAS ASSOCIADAS, 2., 2023, Jaboticabal, SP. Anais... Jaboticabal, SP: Simpoherbi, 2023.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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14. | | IKEDA, F. S.; CAVALIERI, S. D.; FUJIMORI, I. S. T.; SILVA, I. N. da; CONTESINI, M. E.; BASILIO, E. R.; SILVA, J. C. F. da; FAVARO, L.; IEKA, L. V. F.; BAUERMANN, G. S. Seletividade inicial de herbicidas em pré-emergência em cultivares de gergelim. In: SIMPÓSIO DE HERBICIDAS E TECNOLOGIAS ASSOCIADAS, 2., 2023, Jaboticabal, SP. Anais... Jaboticabal, SP: Simpoherbi, 2023.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agrossilvipastoril. |
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15. | | DUARTE, K E. D.; BASSO, M. F.; OLIVEIRA, N. G. de; SILVA, J. C. F. da; GARCIA, B. de O.; DIAS, B. B. A.; CARDOSO, T. B.; NEPOMUCENO, A. L.; KOBAYASHI, A. K.; SANTIAGO, T. R.; SOUZA, W. R. de; MOLINARI, H. B. C. MicroRNAs expression profiles in early responses to different levels of water deficit in Setaria viridis. Physiology and Molecular Biology of Plants, v. 28, n. 8, p. 1607-1624, 2022.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Agroenergia; Embrapa Soja. |
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16. | | PIMENTA, M. R.; SILVA, P. A.; MENDES, G. C.; ALVES, J. R.; CAETANO, H. D. N.; MACHADO, J. P. B.; BRUSTOLINI, O. J. B.; CARPINETTI, P. A.; MELO, B. P.; SILVA, J. C. F.; ROSADO, G. L.; FERREIRA, M. F. S.; DAL-BIANCO, M.; PICOLI, E. A. de T.; ARAGAO, F. J. L.; RAMOS, H. J. O.; FONTES, E. P. B. The Stress-Induced Soybean NAC transcription factor GmNAC81 plays a positive role in developmentally programmed leaf senescence. Plant and Cell Physiology, v. 57, n. 5, p. 1098-1114, 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
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